成份复杂：化学制药废水由于产品各异，造成成份复杂

浓度高：常规制药废水COD在3000-10000mg/L，化学制药废水可高达10万mg/L

色度高：生物制药和中药废水由于发酵和提取过程中会产生褐色色度

难降解：化学合成制药分子量大，且含有N、P、S、CI等卤代物，降解困难